>>69じゃないけど、MathematicaだとJ/Linkや.NET/Linkで
Javaや.NETと連携できるみたいだね。
面倒な計算はMathematicaのエンジンにやらせて、
結果だけJavaで表示って方法じゃダメか？
Mathematicaしか調べてないけど、他の製品にもこういうのあるんじゃない？