Win環境だとmingwとかインスコしてパスも設定しないと行けないから、面倒といえば面倒ね。
Visual Studioも今後低価格化版が出るわけだし。

メリットとしては、マルチプラットフォームに開発する際に全てEclipse+CDTで完結できる事くらい？