Eclipse2.12（日本語化済み）で、デバッグのトレースが別プロジェクトを参照してしまいます。

プロジェクト：Ａ
　┗Hoge.java

プロジェクト：Ｂ
　┗Hoge.java

両者のHogeクラスは似ているのですが違う構成です。
ＢのHogeクラス中にブレークポイントを打つと、
ＡのHogeクラスがトレースされてしまいます。
しかも、トレース位置とソースの内容が食い違ってしまっています。
恐らく表示上はＡのHogeだがトレースされているのはＢのHoge？？？