別の問題なんじゃない?

たとえば、Tomcatでサーブレット動かしてて、文字化けしたとか。
JSPもUTF-8でかいて出力もUTF-8で出力してるのに、文字化けしたとか、ありがちじゃん。

でもって、良く見てみたら、フィルターかましてないとかuseBodyEncodingForURI書いてないとかさ。