長文だとアレだと反省して3・・・10行でまとめてみる。

SS処理⇒
利点、欠点：普通。特になし

MS処理（M成分優先）⇒
利点：左右成分の少ない曲において、重要な音をより良く聞こえさせられる
欠点1：Sに位置する残響成分がMより劣化し、音量も下がるため、奥行き／広がりが若干薄くなる
欠点2：MS処理自体の扱いが難しいため、予期せぬ悪影響が出やすい

○結論
低ビットレートでないのならやはり波形編集だろうとMP3圧縮だろうとMSは使いづらい。
JSに関しても、標準では左右に楽器が存在する時でもMSを使用してしまったりするため、
せめてnsmsfixを下げるなどした方が良い。