iniのデメリット
・iniを起因としたバグが増える
・保存のタイミングなどで、iniファイルそのものが壊れやすい

・部分的なバックアップを自動的に行うスケジュールをユーザーが簡単に組めない

・レジストリのような一般的な作業方法での運用ができない
・セクションごとのアクセス権を細かく設定できない
・比較のためのコストが掛かる
・検索のためのコストが掛かる
・元の環境へ再現するためのコストが掛かる

・データ入力のためのコストが掛かる
・データ出力のためのコストが掛かる

〜結論〜
ほとんどiniにも当てはまります