私は規定ページ数（読み込む紙質によって違う。文庫で50枚、コミックで
40枚くらい）投入して、読み込み後のページ数を見て簡易重送チェックと
して使っている。

表紙とかどうせ分けてスキャンするから、中も分けても合わせる手間は
一緒だから。最初の頃は継ぎ足しもしてたけど、止まったら手間になる
から、やらなくなった。