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ローラーも毎回同じ場所からピックアップするわけじゃないから
ローラーの汚れや変形だとローラー周長の範囲で場所がぶれるのでわ？

自分の経験上、データ転送待ちとかで紙送りが一時止まる時に出やすいので
一度読み取り解像度を変えてみては？

解像度変えて出ないor場所が変わるようなら
データ転送待ちで紙送りが一時止まったあと、
再発進の加速時に紙送り速度が安定しないことで発生してると思う
紙送りの様子と横線の位置を比較してみて〜