もうお気付きの方おられると思いますが、上の方でも話題に出ている
FontPatchin'かRelieverのどちらかを使えば改行問題が解決する様です。

以下に初めて使う方のための簡単な解説も付けましたのでお試し下さい。
またGeneva2Osaka機能拡張を使用していた場合は外すのを忘れないで下さい。
（必要に応じてFontPatchin'コンパネ、FontPatchinInit機能拡張、
FontPatchinLib機能拡張、･Relieverコンパネも外して下さい）

＊FontPatchin'を使う場合
1. FontPatchin' 3.0b4をダウンロードして解凍（以下は直リン）
http://www.yk.rim.or.jp/~harakei/cgi-bin/download3.cgi?bin/FontPatchin3_b4.hqx
2.　"Drop contents into SystemFolder"フォルダ内の3つのファイルを
システムフォルダにドラッグドロップし、再起動
3. FontPatchin'コンパネを起動
4. 右側の白い正方形にEV Novaアプリのアイコンをドラッグドロップ

＊Relieverを使う場合
1. Reliever2000 3.0 をダウンロードして解凍（以下は直リン）
http://www.eac.co.jp/cgi-bin/download.cgi?reliever2000_30
2. "･Reliever"をシステムフォルダにドラッグドロップし、再起動
3. ･Relieverコンパネを起動
4. 左のAdd...をクリックしEV Novaアプリを選択
5. 右のAdd...をクリックしOriginal Font:ポップアップボタンをGenevaに変更し、OKをクリック

＊備考
Charcoalも変更する場合、FontPatchin'だとFontPatchin' Composerを使う必要あり
http://www.yk.rim.or.jp/~harakei/cgi-bin/download_app.cgi?bin/FontPatchinComposer_10b3.hqx

これが皆さんのところでも上手くいって、
これからの作業が少しでも軽減されることを願います。

（ここから関係ない話）
機械翻訳の方ですがこれを記念して（笑）修正しました。
最新はNova D&S (J-MT) 05.sitです。
使えない文字問題の解決方法を81さんが>>229で提案している方法に変更しました。