>>1
CPUの発熱で発電するという事は、
CPUの熱を発電機が奪っている事になるので
それだけでCPUは冷却されるよ。

下手にペルチェやクーラーで冷やしたら
発電機に行く熱が減って発電できる電力が減っちゃうし。
発電した電力は電源に戻す方が良いと思う。


ちなみに>>1の方式のエネルギーの流れはこんな感じ。

電源
↓（電気）
CPU−（熱）→ペルチェ＆クーラー−(熱)→空気
↓（熱）　　　　 ↑
発電機−電気┘