独学に多いのが、両手で全声部いきなり練習してしまうこと。
特にバッハの場合は、各声部を一声ごとにわけて弾くことから始めましょう。
次に、(3声の場合)違う組み合わせで各声部を2声ずつ弾いてみましょう。
そうこうしてるうちに、各声部ごとに暗譜してしまうはずです。
その後ようやく、ゆっくりと全声部いっぺんに弾きます。
大事なのは全ての声部を同じテンポで弾くこと。(最初はゆっくり)

あ、和声の動きも忘れないでね。