わかりやすく言うと、スキャナの場合、解像度が高く、最新の画像エンジンを使っているほうが有利でしょ
単純に考えていいよ。
フィルムスキャナと言えども、圧倒的に解像度の差を空けられては、フラットベッドには敵わない。
悔しかったら、6400dpi以上のフィルムスキャナを出すことだね。