IMEのバージョンが同じなんで実験してみた。
最初は「KUOKA」と入力して変換しても、
「くおか」「クオカ」しか候補なし。
次に、日本語入力システムをオンにした状態で
「cuoca」と打ち込んで、f10キーを押して半角英数に変換。
その後もう一度「KUOKA」と入力して変換キーを押すと、
最初に「cuoca」と変換されたよ。

わかりにくかったらｽﾏｿ。