>>480 といっても付属のバックアップツールが一番マシだと思いますが

・単純にコピー

でいったい何がコピーできているんでしょうか？
そのコピーしたデータで何が復元できるかやってみたことあるんですか？

リストアできなければバックアップとはいえません、単純にコピーなんて方法で
いったい2003Serverのなにをバックアップしている気になってるんでしょう？

不便以前に不十分なバックアップ体制でそれをさらに簡易化しろといわれても

・RAIDでも組んでミラーしておけ

ってぐらいしか提案できませんよ・・・