>>56のフォルダ毎あぼーんアンインストーラーだと、こういう不具合が考えられる。

c:\program files\以下に大量にアプリが入ってる。
>>56のアプリを間違ってc:\program files\直下にインストールしてしまった。
（インストーラーのインストールパス指定時にサブフォルダを作るようにしなかった）
すると、アンインストーラーはc:\program filesにアプリが入ってると判断するわけで、
c:\program files以下にはいってる全アプリを消去する事になる。

チョーーーーだめじゃん。