しょぼしょぼとフリーソフトを作っています。
インストーラには ExePress を使っています。
いままではアップデートのたびに、古いバージョンをすべて削除してもらってから、新しいバージョンをインストールしてもらっていました。
が、できれば新しいバージョンのインストールファイルをクリックするだけで、古いバージョンを上書きで更新できるようになればいいと思っています。
このようなことをしたいとき、気をつけるべきことは何でしょうか？

また、新しいバージョンの配布に際して、すべてのファイルを含む古バージョンと、
以前のバージョンから更新のあったファイルだけを含むアップデータとの二本立てで配布したいと考えています。
このような配布形態をとりたい場合、どのようなことに気をつければよいでしょうか？