GAEを借りてもらう前提として、OSS版を使ってコードを書いてもらう必要があるんだろうからね
どちらでも同じコードが動くようにはしてくれるんじゃないかと思うけど・・・・・
ただGoogleにとってサポートしても得がないCUDAのサポートとか続くんかな？