jarは、zipと同じで、
単にディレクトリ階層を圧縮したものだろ？

ディレクトリをダブルクリックして、起動なんて出来る？

もし出来るなら、そのディレクトリの中に、
ダブルクリックで起動される、起動ファイルが必要だと思う