Aという人がプラグインの仕組みを備えたアプリを作った
そのアプリはGPLではない。

Bという人がプラグインを作った。そのプラグインはGPLである。


この場合に、AとBのプログラムは関係がないどころか、
お互いに相手のことを知らないこともありえるので
どちらもGPLに反しない。