>>117
再現が面倒なので試さずに適当に答えるけど
プロセスが終了した時のウィンドウの順番をWindows任せにしないで、
Javaアプレット側のTerminateイベントでExcelのウィンドウをアクティブにしてから抜けるようにするか
VBAで自分自身を最前面にするか、どっちでも行けるんじゃないかと思う
AppActivate試してみ