svn update する前に気をつける、くらいかな。
まめに保存する（ctrl-Sする）とか、ビルド前に自動保存するとか、
プロジェクトやソリューションの設定を変えたらすぐに保存するとか。
VSならAnkhSVN 併用したり、MS-Officeならmsofficesvnを併用したりとか。