結局ただの数値だってことで理解してきたんですが
・正規化デバイス座標は実際に描画に影響するからこの座標系でx,y,zが-1〜1でなければならない
・普通のウインドウ座標ではこのときのx,yは(-1,-1)が左下(1,1)が右上(これはOpenGLの管轄外？)
・glDepthFuncの初期値はGL_LESS(OpenGL仕様では確認しました)

この事実を考えると、ウインドウで見たときに手前がかかれて欲しいと考えると
正のX軸方向は右
正のY軸方向は上
正のZ軸方向は奥
となって左手系に見えてしまいます。