とはいえ↓の中段に書いてある通りだと思うなあ。
http://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/ms171633.aspx

FlowLayoutPanel内の子コントロールでAnchorまたはDockを指定した場合、実質的に最大の子コントロールの幅に合わせられる。
FlowLayoutPanelの幅ではない。
全部AnchorまたはDockにしていると参照する先がないのでデフォルトになってしまう、と。