久々にこのスレ見に来たら、やっぱり俺と同じ現象で苦しんでる人がいた！
>>124,127,128,147
たぶんこれで解決すると思うんでやってみて。

プロジェクトの上で右クリック
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ビルド・パス(Build Path)
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ビルド・パスの構成(Configure Build Path)
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順序およびエクスポートタブ(Order and Export)
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チェック付いてない奴につける