名前空間については、モジュールの読み込みとは別の仕組みで管理します。
パッケージとシンボルって呼ばれるものの組み合わせですね。

名前空間全体を取り込む場合はcl:use-package、一部を取り込む場合はcl:importを使います。
そういうパッケージを作る場合は、cl:defpackageの中で:useや:import-fromを使う場合が多いです。

名前空間に関しては、プリフィックスを省略せずに書くスタイルの人や、
気にせずどんどんuse-packageしていくスタイルの人など十人十色な感じです。

詳しくは、

http://weitz.de/packages.html

辺りを読むと良いんじゃないでしょうか。