返信ありがとうございました．
検討したところ，>>262の方の言う通りでした．
VBOを二つ用意しても，予め二つ確保した場合では描画されず，
もう一つのウィンドウを作成したあとにもう一つのVBOを確保してやる必要がありました．
皆様，御助言ありがとうございました．