特定のコミットに存在しないファイルを自動で消す方法ってないですか？

例えば linux kernel で v3.0.8 をコンパイルした後に
git checkout v2.6.32.46
とかした時に、v2.6.32.46に含まれない余分なファイル
を簡単に消す方法が知りたいです。