フルグラフ言語?は
gitとかでバージョン管理出来ないから無理

グラフ図形の同一判定や差分抽出は
NP完全じゃなかったっけ?

XMLやJSONみたいなストリームデータが基本で適宜グラフ表示&編集できる
って程度ならいまの言語+IDEと変わらない