おれはUbuntuだけど、APP_BUILD_SCRIPTとかNDK_PROJECT_PATHは指定しない方がいい。
余計トラブルになる可能性大。基本的にはどうしても動かなかった時の最後の手段。

(プロジェクトルート)
　　src
　　jni/Android.mk

とあったら（プロジェクトルート）でndk-buildを呼ぶ。