自力で見つけて一応アルファ付きウインドウの表示に成功したけど
C#のFormクラスのイベントは別途拾いなおす必要があるのか?
http://youryella.wankuma.com/Library/Extensions/Form/LayeredWindow.aspx
参考にしたのはここ

>>573を参考に改造したのがこれ
http://ideone.com/7rfrI
メインのフォームのコードだけ張り替えてくれ