>>381
適当なサンプル作ったので参考までに
(インデントは全角スペースにしてあるので注意)

static void Main()
{
　　Application.EnableVisualStyles();
　　Application.SetCompatibleTextRenderingDefault(false);
　　//Application.Run(new Form1()); // ←フォームはApplicationContextあたりで管理してやれば無駄なメモリは食わない

　　//メニュー
　　ContextMenuStrip cmStrip1 = new ContextMenuStrip();
　　//好きなメニューにする

　　// こいつを使えばFormに関係なくタスクトレイを扱える
　　NotifyIcon ni = new NotifyIcon();
　　ni.Icon = new Icon("../../NET12.ico"); // パスは好きにしてね(ね)
　　niIcon.ContextMenuStrip = cmStrip1; // メニューはこのプロパティでできるみたい
　　ni.DoubleClick += new EventHandler(ni_DoubleClick); // イベント追加
　　ni.Visible = true; // これしないと見えない

　　Application.Run();
}

// タスクトレイのアイコンをダブルクリックしたらメッセージダイアログが出ます
static void ni_DoubleClick(object sender, EventArgs e)
{
　　MessageBox.Show("ok");
}

こんな感じでできるっしょ。