自分、今巻き添えを喰らって投稿禁止中なのですが、ちょうど外泊した場所でネット使えるので質問させてください。

自分のパソコンが手元にないので簡略化して質問させて頂きたいのですが、
fooユーザが/usr/local/apache2/conf/httpd.confをバージョン管理下に置いて、httpd.confを変更後、再起動、実験などを繰り返し
どの設定だとエラーが出たりダメなのかを管理したいと考えております。
この場合、httpd.confをimportして/home/foo/svnにcheckoutした場合、その中のhttpd.confを変更しcommitしても
/apache2/内の本体のhttpd.confは勿論何も変化はありませんが、自分が上で書いたようにhttpd.confをバージョン管理したい場合はどのようにすればいいのでしょうか？

作業コピー/svn/内のhttpd.confを/apache2/内に上書きするようなやり方になるのでしょうか？
また、/apache2/内のhttpd.conf本体をバージョン管理出来るのであればそのやり方を教えていただきたいのですが。
/apache2/内にcheckoutしようとしたらエラーが出て怒られました。