fread/fwriteを使っています。
うまく説明できないのですが、ストリーム暗号なので2回暗号化すれば
元に戻るはずなのです。手動でファイルを指定してコンパイルすると
元に戻るのですが、自動化しようとするとバイナリになってしまいます。
プログラムを見せたほうがいいのでしょうか？