>>24-25
ttp://codepad.org/OxSQOoRw
とりあえず動くように書き換えてみたけど
もっと簡単に考えてみたらいいんじゃない？
２行目以降置換できなかった理由は
start=hit+rep_len; これ
最初の１行目はこれでいいんだけど
２行目以降
strstr(start,find) のstartが無効なアドレスを示して置換できないようになってる
sscanf(line,"%s",src);　の後に
start = src; と入れればちゃんと動くかも