Javaのファイル名は、WindowsやLinuxの環境ではNFCで、Macintosh OS XではNFD。
つまりBazaarがNFCとNFDの変換をすると、JavaのantやMavenの設定ファイルの互換性は高まる。
正直、コンパイルするようなファイルには日本語ファイル名はつけないので大きな問題ではないと思う。