IronPythonは別スレがあるぞ
それはともかく

> こうやってるんだけどさ、pyファイルのパスしか格納されてないんだよね
ドロップしたファイルのパスがargv[1]に入らないってことか

なんかWindowsのコンソールは関連付けやパイプで妙な挙動をすることがあるから
変だなと思ったら>>786みたいに明示的にインタプリタに食わせるといいよ