むかし3日程度使っただけの知識

今のnumpy+scipyにはできないことが色々できる
（統計処理用の表形式とか豊富な統計パッケージとか統計学で使われる特殊なプロット/可視化手法とか...）

言語仕様はクセが強くて、汎用処理はかなり書きにくい。あと、文字列操作とかがやりにくかったりする。

RはそもそもS言語をオープンソース実装するのが出発点

個人的には、仮にnumpyを拡張してPythonのライブラリとして実装しなおしたとしたら、その方が使いやすいだろうなという感じ。