Donut系のIEコンポブラウザは任意にスクリプトやActiveXコントロールの実行のオンオフを切り替える機能を持っている。
そいつらはC++製だけど、WebBrowserのインタフェースはC++にできてVBでできないことはないはずだから、可能だろうとは思う。