>531の言うとおり、Chromeみたいにシステムフォルダ以外にプログラムを置いた場合、
そのプログラム自体は保護されない。
が、プログラム自体も保護したいのであれば、手動でアクセス権の設定を変えておけば、
書き換え等を行う際にUAC発動するようになる。
（そもそもUACとは「権限が不足している時」に「権限の昇格」を行うメカニズム。）

また全てのプログラムを保護しなくても、システムは依然保護されるのだから
>531みたいな運用をしててもUACはちゃんと役割を果たしていると言える。

すなわち>531は運用の問題をUACの欠陥と間違えている。
その辺の教育・啓蒙の不徹底さも込みで問題とするなら分かるけど。

と、横から口を挟んでみる。