全くもってそのとおり
”ずーっと確実に最長1msの周期で観測する”という要件しか聞いていないから,PCの電源が落とされた時点でアウト,
PCの電源落とさないってんなら,たった一日の観測(>>431)くらいで何か分かるわけでもないし.
おとなしくデバイス作ってUSBかシリアルで接続したほうが安心.

GUIはC#でいいだろうが