やりかたはいろいろありすぎて、、、
とりあえず手始めに、fgets()とsscanf()使ってみるのはどうか？
まあ配列に入れるならループで回してstrtokとatoi使う手もあるけど、
最後はstrtok+atoiみたいな関数を自分で作るのがいいかもね。