__gcということはユーザーデータか。ならばスクリプト側からはメタテーブル自体の変更はできない。
さらにメタテーブルに__metatableを追加しておけば隠蔽も可能になり、メタメソッドの変更、追加を防止できる。
ただしこれらはC側やdebugライブラリには効果がないし、制限する手段も（多分）無い。