その後で、
　^([01]?\d\d?|2[0-4]\d|25[0-5])\. (中略) \.([01]?\d\d?|2[0-4]\d|25[0-5])$
として前後の境界を指定して利用してるから問題ないんじゃないの？

数字だけを取り出したいのであれば、例えば、
　\b([01]?\d\d?|2[0-4]\d|25[0-5])\b
みたいに前後を指定する必要があるよね。

って、そういう話ではなくて？