レス番号については、グローバルなレス番号なんか捨てちゃえ、ってのが前のほうで出た。
レスを指し示す手段としてはレスごとにIDがあればいいし、表示用には各自のクライアントが時系列順にでもローカルな番号を振って、IDの代わりに表示すればいい。

スコア制だとホワイトリスティングに近いことができるね。
荒らしでもSPAMでもないレスに対して、半自動でポジティブ評価をするモデレータがいると便利かも。
もちろんモデレータは署名付きで、各ノードは信用するモデレータの評価だけを利用することにして。