当時の様子は知らないし、同じくキューでない配列にも普通にpop/shiftは使うけど
配列から取り除くことが作用ではなく副作用になる場合以外、
「配列から取り除く（ついでに値を得る）」ではなく
「値を得る（ついでに取り除く）」だと思ってるとミスするという話かと。

def get_first(ary)
　ary.shift
end
ary = [1,2,3]
put get_first(ary) # aryが破壊される