これでいいんじゃないの
クローズチェックはやってないけど

#include<stdio.h>
#include<string.h>
#define buff_size 1024
char buffer[buff_size];
int main(){
　FILE *fp; FILE *result;
　int i;
　fp = fopen("sample.csv", "rt");
　result = fopen("result", "w");
　if ( !fp || !result ){
　　printf("ファイルオープンエラー\n");
　　return -1;
　}
　while( fgets( buffer, buff_size, fp ) ){
　for ( i=0 ; buffer[i] ; i++ ){
　　　/* ASCIIしか考慮してないが */
　　if( buffer[i] == ',' )
　　　　buffer[i] = '\t';
　}
　　if ( EOF == fprintf(result, "%s", strafter) ){
　　　printf("ファイル書き込みエラー\n");
　　　return -1;
　　}
　}
　fclose(fp); fclose(result);
　return 0;
}