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「全部閉じとけよ！はどのコードだったのでしょう？」への回答→そんなコードはない。
まさか、最大４２ものブックを開いたところでマクロを実行させるつもりだったのか？
［４２＝マクロブック＋（２列×４０行のデータのブック）＋メールで送られる４０ブック］

FILE_NAME = Dir(SEARCH_PATH & "*.xls", vbNormal)
Do While FILE_NAME <> Empty ' 繰り返し
　　Call PROC_1
Loop
と
WK_PATH = SEARCH_PATH & FILE_NAME
Workbooks.Open Filename:=WK_PATH
Set BK_O = Workbooks(FILE_NAME)
〜
BK_O.Close
FILE_NAME = Dir()
でファイル一覧からひとつずつ開いて転記してクローズしている。
ちなみに、マクロを実行すると変更を保存するかどうかのダイアログが表示されるはず。
その際Ａ４セルの１２桁の番号に対応した９桁の番号がＡ６セルに入っているので確認できる。