> リポジトリ作成くらいは管理者がやるべきじゃないの?
> 初心者に作らせると、trunk、tags、branches構成とか無視して

意味わからん。
trunk とかは、リポジトリの中の話じゃないのか?

> 単にルートに放り投げるだけの環境になりがち

まあ、リポジトリの作成単位をどうするかとか、リポジトリが
増えてきた時の管理を容易にするために、何らかの決め事はい
ると思うけど。