関数ポインタがわりと非効率的なのは確実。
関数呼び出し自体にオーバーヘッドあるし分岐予測しにくいし。

どうすればいいかという話になるとそれだけの情報だとなんとも言えんが、
ラインやフレーム単位では処理が固定できるなら、なるべくそこでまとめるべきだろう