いい忘れましたが上の件は3.2, trunk revision 182484で同様の結果でした。
※trunkのほうはインターナルエラーはでなかったのでパッチは当ててません。
※目的とするclang.exe,libclang.dll,libclang.libなどは得られているのでとりあえずおｋ。

ついでに他の環境でのビルドも聞きたいです。教えてください。
当方としては、32/64bit両方のclang.exeとlibclang.dllが欲しい状態です。

cygwinでx86に対するビルドは問題なく完了するのですが
x86_64に対しては--enable-targetsで指定してもhostと同じものしかみていないのか
完成するものはx86のみになってしまいます。

configure引数は↓のとおりです。

CC_CMD="${CCACHE_CMD}gcc"
CXX_CMD="${CCACHE_CMD}g++"
CC=${CC_CMD} CXX=${CXX_CMD} ../llvm/configure --enable-optimized --enable-assertions=no --enable-targets=x86,x86_64

CC_CMD,CXX_CMDを
x86_64-pc-cygwin-gcc
x86_64-pc-cygwin-g++
などにしてみましたがconfigureは途中までしか逝きませんでした。

また、mingwでのビルドを行う場合、mingw環境のセットアップと同環境でのビルドでないとだめでしょうか？
cygwinにmingwパッケージx86_64-w64-mingw32-gccなどがあるので、こちらでできれば、これらを使用してビルドしたいのですが・・。